STITCH !

Plusieurs années après les événements de Leroy & Stitch, Stitch a quitté Lilo et Kauai et vole dans l'espace sur un scooter des mers qu'il a volé à Jumba, retournant à son ancienne programmation destructrice. Jumba tente de récupérer son expérience génétique, mais les deux se retrouvent coincés dans un vortex. Jumba fait s'écraser son vaisseau sur un astéroïde situé dans l'un des anneaux de Saturne, où il retrouve Pleakley, qui s'y est également échoué. Stitch, quant à lui, s'écrase sur la Terre et se retrouve sur une île d'Okinawa nommée Izayoi. Il parcourt l'île à la recherche de nourriture, puis rencontre une jeune fille nommée Yuna. Après s'être rapprochés au cours d'une tempête, les deux deviennent amis.

Stitch est informé d'une légende d'Okinawa qui lui permettra d'exaucer tous ses souhaits, mais il doit en même temps s'excuser pour les dégâts qu'il a causés à Chitama Town avec Yuna. Pendant ce temps, Stitch tente de faire une bonne action en récupérant une lettre du père de Yuna, qu'elle a jetée à la hâte. Plus tard, Jumba et Pleakley parviennent à échapper à Saturn et à se rendre sur l'île d'Izayoi, où ils retrouvent Stitch. Ils décident de rester avec l'expérience et son nouvel ami, et Jumba finit par fabriquer un bracelet appelé le Compteur de bonnes actions afin de suivre les actions de Stitch tout au long du chemin.

Obaa parle à Stitch et Yuna d'un esprit puissant nommé Kijimunaa, qu'ils partent à l'aventure pour le rencontrer. Après avoir trouvé Kijimunaa, ils apprennent que son arbre natal a été repris par un autre yokai nommé Tachicchu qui l'a battu dans un match de sumo en trichant. Ils apprennent donc à Kijimunaa à se défendre en utilisant son puissant éternuement.

Yuna est bouleversée lorsque sa camarade de classe Penny fait un mauvais dessin d'elle. Après avoir essayé de la faire sourire et avoir échoué, Stitch tente de la réconforter en dessinant des images d'elle souriante, mais il le fait dans toute la maison. Elle lui demande de nettoyer, mais il s'enfuit à la plage où il ramasse sans le savoir le pinceau magique de Bojo, qui a perdu son pinceau en le balançant autour de lui en disant qu'il n'avait plus envie de dessiner. Stitch, en colère contre Yuna, fait un dessin de lui dans le sable et est choqué de le voir s'animer. Le dessin géant de Stitch se déchaîne alors et, malgré tous les efforts de Stitch, il parvient à s'emparer de Yuna. Bojo apparaît et demande à Stitch de dessiner à nouveau la souriante Yuna à l'aide de son pinceau, qui, une fois réalisée, apaise le dessin de Stitch et sauve la vraie Yuna. Enfin, Bojo retrouve l'inspiration pour peindre.

Hämsterviel tente de prendre le contre-pied de la bonne action de Stitch en contrôlant Sparky.

Alors que Yuna et Stitch décident de fabriquer un carillon éolien pour l'anniversaire de Mamie, Stitch reçoit la visite d'Angel et se retrouve avec lui. Yuna essaie d'impliquer Stitch et Angel dans la fabrication du cadeau de Mamie, mais elle se retrouve bientôt seule à le faire. Après qu'Angel ait chanté son chant de sirène à Stitch d'une voix faible, celui-ci devient furieux et sème le chaos dans la ville, finissant par casser le carillon éolien que Yuna a fabriqué pour Mamie. Yuna reproche alors à Angel d'avoir "tout gâché" depuis son arrivée, ce qui conduit Angel à partir en disgrâce. Après que Jumba ait finalement ramené Stitch à la normale, Stitch et Yuna commencent à s'inquiéter après que Mamie ait donné à Stitch un mot d'Angel sur lequel on peut lire "Au revoir". Après l'avoir cherchée sans succès, Kijimunaa révèle qu'il l'a trouvée et qu'il s'occupe d'elle, car elle souffre d'un rhume de cerveau. Après s'être rétabli, Angel aide enfin à préparer le cadeau de Mamie.

Stitch fait naître accidentellement un bébé oiseau qui pense que Stitch est sa mère. Lui et Yuna doivent ramener l'oisillon dans la forêt.

Yuna veut présenter une photo embarrassante à un concours. Elle décide de prendre des photos de Stitch en utilisant l'appareil photo de sa grand-mère, mais il n'y a plus de pellicule, alors elle prend un appareil photo fabriqué par Jumba pour prendre des photos de Stitch. Cependant, l'"appareil photo" de Jumba est en fait un "dispositif de réplication de composé de carbone" conçu pour faire des copies physiques de tout ce qu'il prend et traite en photos instantanées, et bientôt, de nombreuses copies de Stitch sortent de ces photos et envahissent Izayoi. Ils volent des appareils photo et commencent à faire du ragoût d'appareil photo, en disant "Camera !" à de nombreuses reprises, si bien que Stitch doit mettre à terre les nombreuses copies de lui avant que les copies ne détruisent tous les appareils photo de l'île.

Stitch se fait gronder par Yuna parce qu'il a fait du désordre. Plutôt que de nettoyer lui-même, il emprunte un émetteur et appelle Felix à l'aide. Felix nettoie les dégâts partout dans la ville de l'île, mais il commence à nettoyer des antiquités lorsqu'il n'a plus d'ordures ni de dégâts à nettoyer.

Un yōkai nommé Warracchi commence à faire des farces inoffensives et amusantes aux habitants de l'île. Voyant que ces farces semblent rendre tout le monde heureux, Stitch commence bientôt à faire ses propres farces, mais elles deviennent rapidement incontrôlables.

Yuna a une visite de classe à l'usine locale d'ananas. Elle arrive en retard car Jumba a inventé un traqueur de bonnes actions (イイコトメモリ, iikoto memori, mémoire des bonnes actions) pour permettre à Yuna de taper son journal (et de suivre Stitch par satellite selon le doublage anglais). Stitch est plus intéressé à manger les ananas. Deux yokai qui ressemblent à des ananas attaquent alors l'usine d'ananas, épluchant les ananas non traités et mangeant leur chair. Jumba invente un pistolet pour assommer et capturer les yokai.

Yuna tombe malade le jour d'un festival et Stitch part avec Angel à sa place. Stitch rencontre une yōkai nommée Dolores (Foxy Beige dans le doublage anglais), qui promet de faire des feux d'artifice pour Yuna en échange de ses propres affaires.

Noël arrive sur l'île. Hämsterviel a un plan pour hypnotiser tous les enfants de l'île et les obliger à faire ce qu'il veut en mangeant des biscuits diaboliques. Jumba propose un plan pour inverser l'attaque. Après que Yuna et Stitch l'aient arrêté, ils ne pensent pas qu'il y aura un Noël. Lorsque le Père Noël arrive, il demande à Stitch de l'aider à envoyer les cadeaux autour de l'île.

Taro, l'élève de Yuna, n'aime pas manger des aliments sains pour gagner la compétition de ceinture noire. Lorsque Reuben arrive, il prépare des boulettes de riz contenant des aliments secrets pour que Taro puisse gagner.

Yuna et Stitch rencontrent un Feebema nommé Damacchi qui ne s'intègre pas aux autres Damacchis. Ils réalisent rapidement que la raison pour laquelle il n'est pas à sa place est qu'il s'agit d'une pluie de météorites.

Lorsque JJ, un élève du dojo de Yuna, souhaite que son père ne soit pas aussi strict, un yōkai nommé Himamushi réalise son souhait. Yuna et Stitch tentent de convaincre Himamushi de le faire redevenir normal.

Penny montre un livre de son idole, Tetsuo. Yuna et Stitch tirent alors le livre de Penny et Stitch le déchire en deux. Pendant ce temps, dans le dojo de Yuna, des réalisateurs et des producteurs viennent choisir Stitch pour qu'il devienne acteur.

Yuna, Taro et Stitch participent à un concours de chant, mais Stitch se rend compte qu'il ne sait pas chanter. Taro veut vraiment gagner pour pouvoir offrir un voyage aux sources thermales à son père, alors Pleakley lui donne des leçons.

Alors que M. Honda, le facteur, est malade, Yuna et Stitch remettent une lettre oubliée à une femme nommée Mme Tanaka. Pendant ce temps, Jumba et Pleakley trouvent une lettre pour Yuna.

Jumba demande à Stitch d'être son nouvel assistant de laboratoire, mais comme Stitch ne l'aide pas correctement, il démissionne et s'enfuit en ville. Jumba remarque qu'il se passe des choses mystérieuses en ville et rencontre un yokai nommé Topsy-Turvy qui change la donne.

Tout le monde prépare une fête surprise pour Yuna, et Stitch promet de ne pas lui mentir après avoir menti pour avoir mangé son maïs, et Yuna pense que personne ne se soucie d'elle.

Yuna, Stitch, Jumba et Pleakley aident Kijimunaa à se rendre dans les cavernes jumelles pour qu'il devienne un gardien et aide Mamie à se rétablir.

Yuna et Stitch découvrent qu'un trésor est enfoui dans la forêt de la Vallée des Ombres. Angel apparaît et décide de les accompagner. Mais lorsque Mamie leur raconte l'horrible légende du yōkai Pilolo qui vit dans la forêt, ils décident de ne pas y aller. Mais le trésor reste dans l'esprit d'Angel et elle part à sa recherche toute seule. Avec l'aide de Kijimunaa, Yuna et Stitch partent à sa recherche. Ils la trouvent tombée dans un profond coma, et ils doivent maintenant découvrir pourquoi.

Stitch est capturé et toute l'île doit maintenant le sauver. Ses amis, Jumba, Angel, Sparky et Felix sont eux aussi soumis à un lavage de cerveau par Hämsterviel et Gantu.

Hämsterviel demande à Jumba d'absorber l'énergie de la Pierre spirituelle afin d'acquérir le pouvoir ultime, tandis que Yuna prévoit de faire sortir un Stitch rétréci du conteneur en forme de ballon de football américain dans lequel Hämsterviel l'a enfermé.

Penny défie Yuna et sa classe de karaté dans un match de dojo et Stitch décide de se joindre à eux. Il perd le collier de sable de Yuna et pense qu'elle peut faire le dojo sans lui.